(1)注意對殺菌滅藻劑物品的損壞。過氧乙酸濃度超過2000mg/L．不可用在大理石面上；作為室內氣溶膠噴霧時，應將精密儀器用布單或塑料膜罩上；殺菌滅藻劑浸泡物品按時取出，以防損壞。

(2)掌握殺菌滅藻劑的性能。所有使用殺菌滅藻劑的人員必須首先仔細閱讀產品說明書，熟悉使用方法和用量，了解產品使用注意事項。
(3)殺菌滅藻劑的正確配制。在了解殺菌滅藻劑原液濃度基礎上，準確計算，保證足夠的殺菌滅藻劑濃度。過氧化物類消毒劑或含殺菌滅藻劑一般現配現用。
(4)防止誤飲、誤食。使用無色透明的殺菌滅藻劑時，切勿將殺菌滅藻劑置于茶杯或飯碗等用具內，以免被誤當水或飲料飲用，特別要防止兒童誤飲。

(5)注意人員防護。配制過氧乙酸和過氧化氫時，應注意皮膚和眼睛的防護，若不慎將濃溶液濺到皮膚上，立即用清水沖洗?；瘜W消毒劑噴霧，多數情況下均為無人條件，只有用1000mg／L過氧乙酸或15000mg／L過氧化氫水溶液氣溶膠噴霧可以有人在，但不宜有老人和兒童及有呼吸道疾病的人在場。